Ganta est un collégien de 14 ans, qui vivait une vie banale (mis à part qu'il soit un rescapé du tremblement de terre de Tokyo), jusqu'au jour où un homme rouge est venu tuer toutes les personnes de sa classe et le laissa comme seul survivant. Lorsqu'il se réveille à l'hôpital, il est directement accusé d'être le meurtrier. Il se retrouve donc condamné à mort et envoyé dans la prison de Deadman Wonderland.. la seule prison privée du japon. Elle est ouverte au public et fonctionne comme un parc de loisirs touristique. Il y découvrira qu'elle est loin d'être une prison comme les autres.
Il y a quelques détails qui frappent dans le manga,
Il ne parle jamais de sa mère et même s'il parle un peu de son père dans le 1er chapitre ça s'arrête là. Il vivait uniquement avec son père, mais celui-ci n'est apparu à aucun moment depuis le début du manga.
On remarque aussi que sa classe devait se rendre en voyage touristique à la prison de Deadman Wonderland. Il n'avait pas du tout envie d'y aller, parce qu'il préfère aller à l'étranger lorsqu'il faut faire des voyages scolaires plutôt que de rester au Japon. Mais il sera bien obligé d'aller dans cette prison, pour une tout autre raison qu'un voyage scolaire :/